Ma quando riempi il boiler sfoghi l'aria ??
credo di si ma chiedere non fa mai male

Quello che descrivi tu è un problema tipico di mancanza di tenuta, anche se hai già guardato la valvola di non ritorno deve essere per forza lei.
Non conosco il tuo impianto ma, sei sicuro che ce ne sia una sola? anche un granello quasi invisibile o un'incrostazione o un pelucco possono far si che la tenuta sia compromessa. A maggior ragione se te ne accorgi dopo ore di fermo dell'impianto.
Guarda bene

Scusa sono stato preso con parenti cene e affini
Si credo anch' io che ci sia qualche perdita la cosa strana è che te lo fa a riposo di notte.
Il fenomeno è strano perchè se per esempio la valvola di scarico perdesse, la pompa dovrebbe sentire la mancanza di pressione.
però ora rileggendo il tuo post tu hai un impianto con pompa ad immersione che è un classico di ADRIA, il sistema funziona con dei micro interruttori posizionati nei rubinetti, all' apertura degli stessi si chiude il contatto e parte la pompa.
Ora se non ho preso una cantonata pazzesca, il tuo problema è che la valvola di scarico perde,poco ma perde. Non essendoci la pompa automatica che sopperisce alla mancanza d'acqua lo scaldabagno si riempe d'aria e ti crea i problemini da te riscontrati.
Oltre a riparare il problema io cambierei la pompettina d'acquario con una pompa seria  eliminando il circuito elettrico dei rubinetti.
ciao e buon Natale.
Brianza

bene le feste sono finite e come è andata con lo scaldabagno
brianza